O projeto pretende sequenciar o genoma do vírus SARS-CoV-2 que está circulando no estado de Goiás, a fim de conhecer a real diversidade genética do patógeno. Existem descritos na literatura cerca de 198 locais no genoma da SARS-CoV-2 com mutações recorrentes e independentes, que podem indicar uma adaptação contínua do vírus ao seu novo hospedeiro humano. Com isso, torna-se necessário e importante o monitoramento do acúmulo de diversidade genética na SARS-CoV-2, especialmente para informar sobre os alvos de medicamentos e vacinas. Esses resultados também podem contribuir para o estabelecimento das rotas de transmissão, mantendo uma vigilância genética viral, que será importante para o entendimento da quantidade e da forma com que a doença está se espalhando no estado de Goiás e em relação ao país.

Tendo em vista as recomendações da Organização Mundial da Saúde (OMS) para enfrentar a disseminação do novo coronavírus (SARS-CoV-2), causador da doença COVID-19, a presente proposta tem por objetivo utilizar a metodologia de sequenciamento de nova geração (Illumina) para sequenciar amostras do vírus que está circulando no estado de Goiás, uma vez que a partir do sequenciamento do genoma do vírus é possível conhecer a real diversidade genética do patógeno, o que permitirá estabelecer as rotas de transmissão e contribuir para o desenvolvimento de vacinas e drogas para o tratamento. Esse trabalho de vigilância genética viral é importante para o entendimento da quantidade e da forma com que a doença está se espalhando no estado de Goiás e em relação ao país e ao mundo.

Objetivos Específicos do Projeto

- Selecionar amostras de pessoas sintomáticas que testaram positivo para coronavírus

- Extrair RNA viral das amostras selecionadas

- Refazer o teste de PCR em tempo real para confirmar a presença do genoma viral 

- Preparar as bibliotecas do genoma viral para sequenciamento NGS

- Sequenciar e montar o genoma viral a partir dos dados de sequenciamento

- Mapear o genoma e estimar a diversidade de tipos vírus circulante em Goiás

- Comparar as sequencias dos genomas virais encontrados em Goiás com o que está publicado para o restante do mundo

Existem descritos na literatura cerca de 198 locais no genoma da SARS-CoV-2 com mutações recorrentes e independentes, que podem indicar uma adaptação contínua do vírus ao seu novo hospedeiro humano. Com isso, torna-se necessário e importante o monitoramento do acúmulo de diversidade genética na SARS-CoV-2, especialmente para informar sobre os alvos de medicamentos e vacinas. 

Este recurso será essencial, pois permitirá utilizar a capacidade instalada de equipamentos da universidade (que tem origem nos projetos financiados pela FAPEG e pelo governo federal), além do financiamento de bolsas de profissionais que estão na pós-graduação e que tem capacitação para contribuir com essa ação. Assim, permitirá maximizar a eficiência da utilização de uma infraestrutura que já existe na universidade e permitirá o cumprimento dos pilares de pesquisa e extensão considerando a interface universidade/sociedade.